Die fünf staatlichen Museen sind Dienststellen der Abteilung Kultur und gehen auf den Ankauf des privaten Amerbach-Kabinetts im Jahr 1661 durch die Stadt und Universität zurück. Thematisch bilden ihre Sammlungen eine Bandbreite von kunst- und kulturgeschichtlichen, ethnologischen, technischen und naturwissenschaftlichen Bereichen ab.

Seit 1999 gilt für die staatlichen Museen das Gesetz über die Museen des Kantons Basel-Stadt. 2019 begann eine Teilrevision des Museumsgesetzes. Im Januar 2023 wurde diese durch den Grossen Rat verabschiedet. Das revidierte Gesetz wird voraussichtlich 2025 in Kraft treten.

Mit der Revision werden Aufgaben und Kompetenzen hinsichtlich der Führung und Aufsicht der kantonalen Museen geklärt. Die finanzrechtlichen Anpassungen sollen den Häusern bessere betriebliche Rahmenbedingungen, mehr Autonomie und Planungssicherheit ermöglichen.

Mit der Museumsstrategie setzte der Regierungsrat 2017 die grundsätzlichen Leitplanken und Ziele für die fünf staatlichen Museen im Kanton Basel-Stadt und gab sich selbst Richtlinien, wie er die privaten Museen unterstützen will. Die Museumsstrategie setzt die kulturpolitischen Rahmenbedingungen, die als Voraussetzung für ein gutes Funktionieren der Museen gelten sollen. In der Folge wurden in allen kantonalen Museen Betriebsanalysen durchgeführt und daraus Massnahmen abgeleitet.