Im Modellbauatelier werden mit viel Präzision und Können Modelle aus Holz geschaffen. Die Mitarbeitenden pflegen das Stadtmodell, das die Stadt Basel im Massstab 1:1'000 zeigt. Das Stadtmodell besteht aus 57 Elementen und ist fast komplett aus Lindenholz gefertigt. Die verschiedenen Elemente im Stadtraum werden in verschiedenen Farben dargestellt, was einen authentischen Gesamteindruck der Stadt Basel vermittelt.

Zudem stellen die Mitarbeitenden Arbeitsmodelle aus verschiedenen Materialien für Architekturwettbewerbe und Testplanungen her. Diese dienen den Wettbewerbsteilnehmenden als Grundlage. Sie können ihre Entwürfe in das Modell einbauen und es der Jury zusammen mit den erforderlichen Plänen einreichen.